Январь 2000 года. Первое публичное появление Владимира Путина в церкви перед телекамерами на праздничной рождественской службе в Москве в храме Христа Спасителя

Июль 2000 года. Минздрав стал первым российским госучреждением, помещения которого были освящены духовными лицами. Обряд проводил лично патриарх Алексий II.

Август 2000 года. В СМИ появляются сообщения о личном духовнике президента. Им является наместник Сретенского ставропигиального монастыря архимандрит Тихон (Шевкунов)

2 августа 2000 года. Владимир Путин посетил на Ильин день Псково-Печорский монастырь, 40 минут встречался со знаменитым старцем о. Иоанном Крестьянкиным, оставил запись в книге почетных гостей: «Россия и русское могущество немыслимы без усиления нравственных основ общества. Роль и значение Русской православной церкви огромны».

13--16 августа 2000 года. Архиерейский собор РПЦ канонизировал царскую семью, принял документ о социальном учении церкви (Основы социальной концепции РПЦ), обратился с напутствием к президенту, в котором главу государства просили дать новый импульс в решении проблемы церковной собственности.

Осень 2001 года. В Кремле обсуждаются планы возрождения совета по делам религий при президенте для урегулирования государственно-церковных отношений.

Февраль 2002 года. Резкое ухудшение в отношениях между Римско-католической и Русской православной церквами после того, как Ватикан повысил статус своего миссионерского присутствия в России (заменил временные апостольские администратуры постоянными епархиями во главе с митрополитом). Вскоре после этого события МИД РФ объявил персона нон-грата нескольких католических священников и одного епископа, осуществлявших свое служение в России.

Август 2002 года. Председатель комитета по аграрно-продовольственной политике Совета Федерации Иван Стариков предложил принять поправки в Земельный кодекс, вернув религиозным организациям право постоянного бессрочного пользования земельными участками. По его словам, традиционные конфессии должны иметь право взять столько земли, сколько смогли бы обрабатывать.

25 июня 2003 года. Выступая перед учеными кругами в Эдинбурге, президент сказал, что светские власти России делают все, чтобы сблизить позиции римского Святого престола и Русской православной церкви. Владимир Путин подчеркнул, что «знает о мнении патриарха Алексия II по этому вопросу». Однако рассчитывает, «что отношения между Святым престолом и РПЦ будут развиваться позитивно».

Сентябрь 2003 года. Президент встречается в Нью-Йорке с главой Русской православной церкви за границей митрополитом Лавром и передает ему приглашение приехать в Москву от Патриарха Московского и всея Руси Алексия II.

Ноябрь 2003 года. В Москву прибыла делегация зарубежной Русской православной церкви для переговоров о воссоединении с Московским патриархатом

2 февраля 2004 года. Патриарх Алексий II и руководитель Пенсионного фонда России (ПФР) Михаил Зурабов подписали соглашение об увеличении пенсий священнослужителям. В советское время денежное пособие духовным лицам выплачивалось из церковных средств. С 1990 года священников уравняли в правах со служащими, но трудовой стаж до 1990 года не учитывали при расчете пенсий.

3--4 февраля 2004 года. VIII Всемирный русский народный собор провозгласил, что церковь должна заниматься геополитическими вопросами, а также принял Свод нравственных принципов и правил в хозяйствовании, который достаточно быстро окрестили "десятью заповедями коммерсанта".

Февраль 2004 года. По просьбе ГИБДД и с благословения митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского Владимира в православных храмах северной столицы по окончании службы прихожанам напоминают о необходимости соблюдения Правил дорожного движения.